
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探讨结果显示
的研究技术人员探究性学习伴随着速冻时加长了牛羊肉的对抗强度标准、持反击式水轮机、成色、分离于铁含磷量、ROS、脂质过空气金属氧化物、MDA、GSH和GPX4情况来监测手臂肌肉策划 癌神经细胞的铁消亡睡眠状态。报告展现,速冻时加长了后,牛羊肉的对抗强度标准在第5天和第6天正相关减低;持水水平变低;色彩变深,失去了亮光,鲜红改成暗红。因此,分离于铁、亲水性氧和MDA的含磷量正相关扩大,癌神经细胞凋亡率正相关偏高。 论述工作人员抽取不一样保鲜冷库时刻的肌合格品的血清质,之后完成SDS-PAGE定性研究分析,血清质条带在不一样时分布区匀称且相类似(图1a)。选择血清在不一样合格品中的抒发时候,定性研究分析感觉同个组合格品的中个数相近于同个水准(图1b),阐明肌合格品血清质具备着正常的组内相类似性和组间对比性。 血清质组学共签别出1996种血清质。以B0为较组,挑选B1、B2、B4和B6中的血清展开之间的关系表答数据定性分析,共签别到37几个DEPs。将火山图可视化数据,并依照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.053个规则数据定性分析DEP。但是如1c-f如下图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别签别出22、33、73和140个DEPs,在当中分发型别上浮6、11、32和8九个,调低16、22、41和55个。聚类算法工艺测评了有对比冷藏箱环节肌组识组识中血清质的表答,但是展现肌组识血清表答之间的关系随着时光的推移儲存时光的提高而提高(图1g)。
图1| 各不相同要在冷藏室保存的时间的肌肉组织图纸淀粉酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种速冻期限的手臂肌肉打样定制差异化蛋白质数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死掉蛋白酶肽的PRM定量阐述阐述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 鉴于KEGG聚集不一致性抒发蛋白质的铁死掉机制化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT酶联免疫法球蛋白酶质组学枝术服务培训于,拜谱菌物已研发部门成功并搭建了完美稳定的转录组学、球蛋白酶组学、代谢率组学包括两组学共同物料枝术服务培训于管理体制,欢迎致电咨询!
基准文献综述:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.