
2024年9月由东莞林果一本大学张万刚专家团对在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生态学为该研究提供了亚硝基化表达组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文翻译小标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202历经四年的影响因素:5.7
先生发表耗时:2024年9月
雇主公司的:南京农业大学
研究分析产品:蛋白
拜谱给出科技:亚硝基化修饰组学
技术应用路径:
一、论述的结果
01.Caspase-3活力
现下尚不模糊不清NO对caspase-3的控开发用是否能够归因于NO介导的S-亚硝基化,有所不同渗透压系数的GSNO当做外源性NO厂家直销,以诱导性caspase-3的离体S-亚硝基化。可是体现了,与如果没有GSNO的组比起来,100、200和400μM GSNO组的caspase-3渗透性酶类强势减低(图1),与仍然有关报道一直。GSNO工作减低caspase-3渗透性酶类的风险原故仍亟需阐发。
图1 各不相同含量的GSNO进行处理对caspase-3可溶性的导致
02.Caspase-3的S-亚硝基化能力
的分析Caspase-3的亚硝基化能力,以展现GSNO对Caspase-3的生理反应性。经GSNO加工处理后,探测到caspase-3核蛋白S-亚硝基化硬度不断增加(图2)。等成果阐明,外源性GSNO培养计划可成功率介导caspase-3的身体S-亚硝基化。最令难以相信的是,在是没有GSNO会出现的参考组中探测到其中一个绚烂的S-亚硝基化带,这阐明caspase-3或者进行内源性的S-亚硝基化。除此之外,本的分析中caspase-3的S-亚硝基化能力较高,而caspase-3的化学活化减轻,这与前面的的分析一直。所以,caspase-3的特情人S-亚硝基化装饰位点尚不模糊,还须得进一大步的探险。
图2 GSNO加工对caspase-3S-亚硝基化品质的不良影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化遮盖组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。黑色标签的字段表现S-亚硝基化肽,黑色标签的C表现S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3分解结核蛋白
结球球血清为一些关键的神经肿瘤细胞骨架球球血清,在确保肌神经肿瘤细胞的机构的的机构系统性和缩水性方便起着关键效应,深入分析S-亚硝基化caspase-3对结球球血清化学降解塑料的敏锐性兼具关键重要性。与Std(未用胱天球球血清酶-3和GSNO孵育的原始肌弹性玻璃纤维球球血清)组相比较,0 μM GSNO组(肌原弹性玻璃纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的系统结球球血清纯度特殊减小,显示caspase-3对结球球血清兼具隐藏的的球球血清电离程度。在GSNO孵育后,系统结球球血清的纯度清晰加大(P < 0.05)。除外,当GSNO质量浓度身高时,系统结球球血清的纯度维持上浮(P < 0.05)(图5)。相应出现 表面,SNO修饰语的caspase-3以关卡信任的的方法控制结球球血清的化学降解塑料。
图5.S-亚硝基化caspase-3生物降解结血清
05.S-亚硝基化Caspase- 3生物降解肌钙血清-T
肌钙球蛋清酶质-T (TnT)是原肌球球蛋清酶质调控进行肌群拉伸的丝条的一定肌原合成玻纤球蛋清酶质。TnT的可光溶解特证是检查测量到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化前提条件下,caspase-3对TnT的可光溶解原因长为6如图是,与Std组(中含caspase-3和GSNO的肌原合成玻纤)比起来,caspase-3组中30 kDa TnT情节取得扩大,表达caspase-3参与者了TnT的可光溶解,凡此种种,caspase-3与GSNO的孵育以至于30 kDa TnT减低。在100和200 μM GSNO组之中如果没有检查测量到比较突出的的差异(P > 0.05),而当GSNO的浓硫酸浓度到400 μM 时,该情节取得以减少(P < 0.05)。这挖掘表达了SNO绘制的caspase-3对TnT可光溶解的治理和改善的作用。结球蛋清酶质和TnT是caspase-3的神经敏感底物,而GSNO处里调低caspase-3的吸附性酶可能性以至于肌原合成玻纤球蛋清酶质可光溶解程度较调低。结合以上根据上述,NO诱导性的S-亚硝基化不错经过绘制半胱氨酸残基来调控caspase-3的吸附性酶,必将进两步损害到其对结球蛋清酶质和TnT的球蛋清酶质蛋白质水解程度,然而损害到羊肉品质保证。
图6. S-亚硝基化caspase- 3挥发肌钙蛋白酶-T
二、总结
本实验重要途径浅论S-亚硝基化对caspase-3表达的的影响到举例然后对鸡肉肌原仟维棉体内生物降解的的影响到。淀粉酶质S-亚硝基化都可以表达caspase-3的半胱氨酸残基,最终得以导致caspase-3生物拉低,切实骤抑止了其对鸡肉肌原仟维棉淀粉酶质的淀粉酶质油脂水解效率。三、拜谱工作小结
设计方案采用了了酶活判断,亚硝基化装饰组学探讨,WB等查重措施,发掘淀粉酶S-亚硝基化能否装饰caspase-3的半胱氨酸残基,这促使了caspase-3活性酶类的削减,并举一步骤压制了其对牛羊肉肌原植物纤维淀粉酶的淀粉酶水解反应的能力。本设计方案为解悉淀粉酶质亚硝基化对肉肥的房产调控原则能提供了了个新的画面。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的核脂肪酸组学、修饰语核脂肪酸组学、细胞代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸型号产品设备,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total氧化反应重置、游离态巯基,欢迎大家咨询!
分类论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663