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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
排泄重编程序是肿癌情况和进步的圆形标志,红提糖排泄的转换起着核心理念影响。此类转移使肿癌神经元能够高效收集养分并诞生所需的排泄中心体,若想可以促进生长发育。也许兼有根本意义上,但肿癌神经元上涨糖酵解的管理机制仍不知晓。

近日,杭州医科本科大学一号加盟医疗机构王学浩博士管理团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向治疗激光能量排泄检测分析服务。

英语文章标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

繁体中文大标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

买家行业:南京医科大学

探析建材:细胞

拜谱给予提供服务:转录组测序+蛋清互作组+靶向药物动能分泌组

技木行车路线:

分析結果

01、YBX1被签定为HCC中糖酵解的至关重要DNA

本调查提取HCC肉瘤样版(n=7)的单神经元RNA测序统计资料集开始介绍,显示糖酵解几丁质酶首要分布在肉瘤神经元中,hdWGCNA介绍判断出9个基因组摸块(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的我的世界我的世界生存介绍断定YBX1为独立环境我的世界我的世界生存的风险原因(图1H)。进三步依照IHC、WB试验和肉瘤阻止与挨近非肉瘤阻止的环境转录组学统计资料集印证YBX1是肝神经元癌中药治疗的内在靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被确定好为调理HCC组织糖酵解的最为关键的因素分析

02、YBX1有利于HCC中的有氧糖酵解和增值

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法体力分泌组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1增强HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖

03、OGT与YBX1融合并可以淡化YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1联系并推动YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增强学习其磷碱化,然后催进其核转位

进这一大步判断YBX1的O-GlcNAc糖基化是影向其磷碱化,在OGT敲低的HCC组织中或用OGT阻止剂OSMI-1除理,YBX1蛋清质含量取得拉低,YBX1磷碱化取得减掉(图4A-C)。IP科学实验表示,在同的Flag-YBX1底物含量下,YBX1-WT的磷碱化含量取得要高于YBX1-T57A,说明磷碱化的曾加实际上仅是鉴于更大的YBX1蛋清质表示(图4D)。破乳了核和质成分发掘TMG除理的HCC组织中YBX1核表示的增加(图4E-F),进这一大步发掘YBX1磷碱化的要素调整系数是AKT(图4G-I)。这部分发掘特别指出O-GlcNAc糖基化用强化其磷碱化来强化YBX1蛋清质不稳判定性并强化核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 绘制优势于其进那步遭受磷碱化绘制并也可以利于其核转位

05、YBX1推动PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1使得PKM2转录

06、YBX1 是可以增进组蛋白酶乳酸性反应呈现水准

深入分析遇到YBX1敲低同质性拉低淀粉酶质乳硝凝成用,更是是H3K18乳硝凝成用(图6A-C)。糖酵解调节剂2-DG的实验英文印证了糖酵解与组淀粉酶乳硝凝成用的进行联系,调节糖酵解可同质性拉低H3K18la情况(图6D)。PKM2过表明可逆性转YBX1敲低导致的的H3K18la变低,以外源乳酸治理不仅能升级H3K18la,还伴着YBX1表明上浮,建议具有同向调查问卷(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR印证,H3K18la用生物富集于YBX1重启子进行有利于其转录,该环节受O-GlcNAc糖基化调节(图6H-J),并遇到P300 上浮是YBX1增加H3K18乳酰凝成用的长效机制(图6K-L)。

图6.YBX1提升H3K18乳碱化绘制层次

内容工作小结

在这个研究探讨中报道范文了YBX1在HCC中高表现方式,然而与糖酵解开切有关于。YBX1在T57处被O-GlcNAc掩盖,然而固定球膳食纤维并不断增加其表现方式。这样掩盖还催进YBX1在T57处的磷碱化,催进其核易位。那么,某种过程中 增进了糖酵解有关于染色体的转录并影响乳酸的出现。最后,YBX1刺激启动P300的转录,继而驱动软件组球球蛋白的乳碱化,尤其是是H3K18la,H3K18乳碱化同向调整YBX1染色体转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观遗传基因正负极馈环制度化图

拜谱工作小结

本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱微生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向疗法电量细胞代谢组技术服务,拜谱生物技术建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、译成后绘制组学、代谢转化组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

参看资料

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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