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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核海洋微生物mRNA中最核心要的转录后淡化,在真核海洋微生物的病理学和生理上流程中起着至关核心的角色。痛风认识阻碍不是种不不可逆转的中枢周围神经周围神经软件系统退行性肠道疾病,目前为止不断发展实际上切逻辑暂未可以阐发,但会欠缺有效果的有效防范和调理行为。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱怪物为其提供m6A甲基化了解水平保障,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

文章内容各称:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

玩家企业:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

探析的材料:小鼠脑组织

拜谱能提供方法:m6A甲基化(MeRIP-seq)

内容提要图:

图1| 英文论文图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

理论研究导致

1.DCI小鼠海马中m6A人类基因突显的转换

科研者率先加入了高脂美食和认识程度功能障碍(DCI)的小鼠模式。为很剖析组(n = 3)和DCI组(n = 3)期间的m6A人类人类表观遗传遮盖,科研者使用的MeRIP-seq实现了转录组的范围内的m6A-seq讲解。在DCI组的10664个打码人类人类表观遗传转录物(mRNAs)共产党出现剖析组的23719个不交叠的m6A峰。比较一下,DCI组表达出23,759个非交叠m6A峰。其中的,9348个甲基化人类人类表观遗传在剖析组和DCI组期间交叠(图2)。

图2| 对比组和DCl组m6a遮盖染色体的维恩图

共鉴别出127七个对比定性分析甲基化的m6A位点(DMMSs),当中60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化横向分别是为特殊低过對照组。定性分析其数据规划条件遇到m6A峰数据规划在这个RNA中(图3A),并结合其数据规划的转录领域包括以内五组:5'UTR、3'UTR、转录起讫位点领域场面、撤销解锁解锁账号密码子场面、起讫解锁解锁账号密码子场面和简码字段(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和撤销解锁解锁账号密码子左右为特殊含有(图3B)。要为评价这样DNA上m6A遮盖语的领域,探析者淘汰了有峰注脚的领域,并测量了这样DNA上reads的使用率率。在DCI组中,m6A遮盖语区偏袒于3'UTR区(图3C)。各种mRNA内的DMMS都被精准定位到着色体上来评价其数据规划概述。有差异 小鼠着色体的m6A遮盖语谱有差异 。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的改变了

为了让开展m6A绘制在DCI小鼠中的生态学学功能模块,科学研究师从两队数中择包含的DMMS的蛋清质代码人类dna实行GO和KEGG进行介绍(图4A)。在GO进行介绍中,高甲基化人类dna在组织流程、生态学流程调整、崔化反应崔化渗透性和杂环巧妙物融入中不错丰度。KEGG通道进行介绍呈现,高甲基化人类dna与T组织蛋白激酶卫星手机卫星信号通道、小组织肺肿瘤和RIG-I样蛋白激酶卫星手机卫星信号通道一些(图4B)。这对于低甲基化人类dna,GO进行介绍呈现在组织流程、代谢转化流程和融入流程中不错丰度巧妙环巧妙物、融入杂环巧妙物和崔化反应崔化渗透性(图4C)。KEGG通道进行介绍阐明了低甲基化人类dna与肥厚性心肌病和Hippo卫星手机卫星信号通道的锁定(图4D)。

图4| 差异性甲基化m6A位点的环路丰度

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq的数据的聯合探讨

陆陆续续调查员将m6A MeRIP-Seq的数据资料提示和仍然RNA-Seq的数据资料提示实行携手剖析,表明163个mRNA,m6A峰和mRNA总体的能力相关性发生变化。41种mRNA的m6A和mRNA总体的能力调涨,14种mRNA总体的能力再降。显然,30个表观遗传mRNA展示调涨,m6A总体的能力再降,7九个表观遗传mRNA展示再降,m6A总体的能力调涨(图5A)。第三,在校园营销推广活动的环节之中所构建了个PPI在线来提示163个表观遗传编号的蛋清彼此的连接方式(图5B)。

图甲6下图,GO和KEGG了解可分四组:(1) m6A调涨,mRNA变动;(2) m6A调涨,mRNA调涨;(3) m6A变动,mRNA变动;(4) 人类人类什么是染色体组m6A变动和mRNA调涨。在GO了解中,m6A调涨和mRNA变动的人类人类什么是染色体组在人体生殖细胞系膜产生具体步骤、芬香族有机物海洋生物镶嵌具体步骤和RNA产生具体步骤的调空中同质性丰度。KEGG了解表明,这个人类人类什么是染色体组在肌肉人体生殖细胞系酸产生、小人体生殖细胞系膜1.肺癌、丙酸产生和异丙醇酸产生中丰度。就m6A调涨和mRNA调涨的人类人类什么是染色体组,GO了解表明在亚铁紧密联系、亚胺丙氨酸脱羧酶吸附性、天冬氨酸1-脱羧酶吸附性和人体生殖细胞系膜相连安装负调空中丰度;KEGG了解表明在2型心脏病、肌肉人体生殖细胞系人体生殖细胞系膜指数公式讯号环路和胰岛素讯号环路中丰度。在GO了解中,m6A变动和mRNA变动的人类人类什么是染色体组在寡肽紧密联系、谷胱甘肽紧密联系和二硫防氧化反应物防氧化反应备份酶吸附性中丰度,而在KEGG了解中,想一想在柠檬片酸配置(TCA配置)、丙酸产生和多动物群凋亡中丰度。在GO了解中,m6A变动和mRNA调涨的人类人类什么是染色体组在胚胎骨骨关节形态特征發生、血清激酶吸附性成功激活和NADP产生具体步骤中丰度,在KEGG了解中,m6A变动和mRNA调涨人类人类什么是染色体组在新霉素、卡那霉素和神经末梢营养品指数公式讯号环路中丰度。

图5| m6A甲基化与mRNA展现的联合技术讲解

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG定性分析

拜谱生物工程工作小结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生物技术提供了m6A甲基化能力售后服务,拜谱微生物可提供完善成熟的蛋白质组学、细胞代谢组学、转录组学并且两组学携手产品的技术设备的服务,欢迎致电咨询!

参考选取论文:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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